当我加载包时，我收到一条消息：
"The following object is masked from 'package:xxx'
例如，如果我加载testthat然后assertive，我得到以下信息：
library(testthat)
library(assertive)
## Attaching package: 'assertive'
##
## The following objects are masked from 'package:testthat':
##
## has_names, is_false, is_less_than, is_null, is_true
此消息是什么意思？我该如何防止它？
答案
该消息意味着这两个包具有相同名称的函数。testthat和assertive包包含五个同名的函数。
当两个函数同名时，哪个函数会被调用？
R 将查看search查找函数的路径，并将使用它找到的第一个函数。
search()
## [1] ".GlobalEnv" "package:assertive" "package:testthat"
## [4] "tools:rstudio" "package:stats" "package:graphics"
## [7] "package:grDevices" "package:utils" "package:datasets"
## [10] "package:methods" "Autoloads" "package:base"
在这种情况下，由于assertive被加载后testthat，它出现在搜索路径的前面，因此将使用该包中的函数。
is_true
## function (x, .xname = get_name_in_parent(x))
## {
## x <- coerce_to(x, "logical", .xname)
## call_and_name(function(x) {
## ok <- x & !is.na(x)
## set_cause(ok, ifelse(is.na(x), "missing", "false"))
## }, x)
## }
<bytecode: 0x0000000004fc9f10>
<environment: namespace:assertive.base>
中的函数testthat无法以通常方式访问；蒙面的。
如果我想使用屏蔽函数之一怎么办？
您可以在调用函数时使用双冒号运算符显式提供包名称，::。
testthat::is_true
## function ()
## {
## function(x) expect_true(x)
## }
## <environment: namespace:testthat>
如何抑制该消息？
如果您知道函数名称冲突，并且不想再次看到它，可以通过传递来抑制该消息warn.conflicts = FALSE到library。
library(testthat)
library(assertive, warn.conflicts = FALSE)
# No output this time
或者，使用以下命令抑制消息suppressPackageStartupMessages：
library(testthat)
suppressPackageStartupMessages(library(assertive))
# Also no output
R 的启动过程对函数屏蔽的影响
如果您更改了 R 的一些启动配置选项（请参阅?Startup）您可能会遇到与您预期不同的功能屏蔽行为。?Startup应该能解开大部分谜团。
例如，那里的文档说：
请注意，当获取站点和用户配置文件时，仅加载基础包，因此其他包中的对象需要通过例如引用来引用。
这意味着当通过类似文件加载第 3 方包时.Rprofile您可能会看到这些包中的函数被默认包中的函数掩盖，例如stats，而不是相反，如果您在 R 的启动过程完成后加载了第 3 方包。
如何列出所有屏蔽函数？
首先，获取搜索路径上所有环境的特征向量。
library(dplyr)
envs <- search() %>% setNames(., .)
对于每个环境，获取导出的函数（和其他变量）。
fns <- lapply(envs, ls)
将其转换为数据框，以便于与 dplyr 一起使用。
fns_by_env <- data_frame(
env = rep.int(names(fns), lengths(fns)),
fn = unlist(fns)
)
查找该对象多次出现的情况。
fns_by_env %>%
group_by(fn) %>%
tally() %>%
filter(n > 1) %>%
inner_join(fns_by_env)
要测试这一点，请尝试加载一些具有已知冲突的包（例如，Hmisc,AnnotationDbi）。
如何防止名称冲突错误？
这conflicted每当您尝试使用名称不明确的变量时，程序包都会抛出错误并提供有用的错误消息。
library(conflicted)
library(Hmisc)
units
## Error: units found in 2 packages. You must indicate which one you want with ::
## * Hmisc::units
## * base::units